O treinamento propiciado na FMUSP é considerado de excelência, como demonstra o grande número de residentes de outras instituições e de todos os estados do Brasil que se candidatam aos programas de Residência Medica da FMUSP. Houve um crescimento do número de candidatos nos últimos anos, passando de 4.340 em 2014 para 5.294 em 2019.
