A missão do Curso de Fisioterapia da FMUSP atendendo às diretrizes internacionais que apontam que um fisioterapeuta completo é um profissional ético, competente, reflexivo, que atua com expertise e cientificidade, baseado em evidências e que respeita a diversidade, é formar um fisioterapeuta geral, apto a atuar de forma competente e crítica nos vários níveis de atenção à saúde.

A visão do Curso de Fisioterapia é formar fisioterapeuta com sólida formação geral voltada a se tornarem aptos a exercer sua profissão nos três níveis de atenção à saúde (primário, secundário e terciário). Constitui também em incentivar o aluno a compartilhar informações e conhecimento, agregando valor à ciência, à inovação e à qualidade.

Os valores implícitos à formação do fisioterapeuta são pautados nos princípios de ética, respeito ao indivíduo, humanização, honestidade, pioneirismo e excelência. Pretende-se também a formação de profissionais aptos ao desenvolvimento, à difusão e à aplicação de conhecimentos de acordo com as necessidades do contexto brasileiro e em diálogo com o cenário internacional.