O Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina da USP foi inaugurado no dia 19 de abril de 1944. Considerado um dos principais complexos hospitalares do mundo, desde as primeiras discussões a respeito de sua criação, o HC foi concebido para abrigar serviços de diferentes especialidades médicas que se consolidavam naquele momento. A criação do hospital-escola da Faculdade de Medicina era almejada pelos alunos e professores da instituição desde os primeiros anos de seu funcionamento. Ao longo da década de 1930 o corpo docente e o corpo discente da Faculdade se engajaram na luta pela criação do Hospital pressionando o governo paulista a oferecer melhores condições para o desenvolvimento do ensino, pesquisa e assistência empreendidos pela instituição.

Enquanto as aulas práticas da FMUSP seguiam sendo ministradas na Santa Casa de Misericórdia, as obras do HC tiveram início em 1938. Deste modo, o governo de São Paulo cumpriu o acordo que havia firmado com a Fundação Rockefeller, ainda na década de 1920, pelo qual a administração paulista deveria construir um hospital-escola como contrapartida ao financiamento oferecido pela instituição para a construção da sede da Faculdade de Medicina. O incremento das atividades de ensino, propiciado pela envergadura do Hospital das Clínicas, somado ao ambiente de pesquisa já consolidado na Faculdade, permitiram a criação de vários institutos especializados que se desenvolveram como elementos de articulação acadêmica. Nas décadas seguintes, especialmente a partir de 1952, os institutos foram implantados e se tornaram reconhecidos como instituições de referência em suas respectivas áreas, dentro e fora do país, com impacto significativo na estruturação do campo médico e no atendimento da população da capital, do interior, bem como de diversas regiões do país.