O Centro, composto por um centro de criogenia e uma sala de freezers, funciona como um núcleo multiusuário de acesso restrito aos pesquisadores do Sistema FMUSP-HC para os freezers e é aberto a todos os pesquisadores no caso da criogenia.

Em outubro de 2015 foi inaugurada pelo presidente da Fapesp, Prof. Dr. José Goldemberg, a sala de freezers do centro, em área anexa ao Biotério da FMUSP, originalmente com capacidade para abrigar 100 freezers a -80°. A facility é contígua à área de criogenia, já operante e financiada com recursos provenientes do PROINFRA FINEP 2006 (SP/6). A sala, construída com recursos da Universidade, foi equipada com recursos do processo Fapesp 2011/51974-0.

Já estão instalados 60 freezers no local, que dispõe de sistema de monitoramento de temperatura interna dos equipamentos, controle de acesso por biometria, câmera de monitoramento de acesso quatro centrais de ar condicionado e gerador exclusivo.

Com recursos da reserva técnica foi contratado um projeto de readequação da sala de forma a melhor aproveitar o espaço. Com as intervenções será possível abrigar até 110 equipamentos. O projeto definiu o padrão de freezer a ser aceito no Centro de Armazenamento e também identificou área próxima ao Centro que pudesse receber um gerador de 450 kVAs que atende exclusivamente o Centro de Armazenamento.

O Centro, que tem sido um diferencial do Sistema para a atração de projetos de pesquisa internacionais, como o projeto SAND, que prevê a coleta de 5000 hemisférios cerebrais e grandes projetos estratégicos nacionais como o teste clínico da vacina da dengue.

Em dezembro de 2012 foi incorporado à FMUSP, através de acordo firmado entre as Diretorias desta Faculdade e do Instituto de Química, com anuência da Pró-Reitoria de Pesquisa, o prédio do antigo Núcleo de Terapia Celular e Molecular, hoje um centro vinculado à diretoria da FMUSP. Concebido pelo Instituto de Química, o edifício tem 2.200m², é provido de ar condicionado central, gerador e unidades de operação para equipamentos de maior porte, além de contar com uma sala limpa classe B2. A FMUSP viabilizou o início das operações através da contratação dos serviços de vigilância e limpeza, transporte de equipamentos, instalação de infraestrutura e fornecimento de gases medicinais para criogenia e implantação de rede lógica, entre outros.

O centro tem se destacado na realização de pesquisa e desenvolvimento em parceria com a iniciativa privada, como convênio de pesquisa e desenvolvimento firmado em 2015 com a empresa Ouro Fino Saúde Animal, e da obtenção de patentes.

O prédio principal da Faculdade de Medicina da USP (FMUSP), onde também se localiza o Serviço de Verificação de Óbitos da Capital (SVOC), e o prédio do Biotério Central, todos localizados no campus de Pinheiros da USP, enfrentaram problemas constantes devido à queda e oscilação da energia, Os laboratórios de pesquisa não recebiam alimentação alternativa, o que causava enormes prejuízos para as pesquisas em andamento, com perda de material biológico e dano a equipamentos.

Para estender o acesso à geração alternativa de energia a todas as áreas de pesquisa da FMUSP, SVOC e Biotério foi elaborado projeto que previu a necessidade de aquisição de dois novos geradores (sendo um deles cabinado), a transformação de um gerador existente e o reaproveitamento de um gerador existente em outro local. Também previa o redimensionamento e consequente substituição dos painéis elétricos das subestações elétricas e novos cabeamentos. A execução desse projeto foi incluída em três projetos de Reserva Técnica Institucional da FAPESP.

Em fevereiro de 2016 foi contratado o fornecimento de dois geradores, um cabinado de 500 kVA, trifásico, e um de 625 kVA, trifásico. Este último equipamento veio a substituir um equipamento existente de 450 kVA, que foi reaproveitado para servir exclusivamente ao Centro de Armazenamento de Amostras Biológicas, implantado em julho de 2018.

Com a execução do projeto foi possível dotar o Edifício Sede da FM e o Edifício de Autópsia Virtual, acoplado ao Serviço de Verificação de Óbitos da Capital, de um sistema de geração alternativa de energia que atende a todos os laboratórios de pesquisa da unidade instalados nesses edifícios.